《你与我最后的战场，亦或是世界起始的圣战 第二季》

科学技術が発達した、機械仕掛けの理想郷「帝国」。

超常の力・星霊術を駆使し、“魔女の国”と恐れられる「ネビュリス皇庁」。

二国は長きにわたる戦争を続けてきた――。

帝国の最高戦力イスカと皇庁の王女にして“氷禍の魔女”アリスリーゼは、

激闘の中で互いの素顔に触れ、その生き方と理想に惹かれ合う好敵手となった。

独立国家アルサミラで帝国と皇庁の謀略を打ち砕いた二人は、

再会を誓ってそれぞれの道へと進むが、意外な形でその約束を果たす。

アリスの妹シスベルと取り引きを交わし、護衛として皇庁に潜入するイスカ。

シスベルの捜索隊として皇庁の都市リースバーテンを訪れるアリス。

偶然の再会は二人の心をさらに燃え上がらせるが……

同時に皇庁内では帝国の内通者「純血種・被検体E」が暗躍し、

帝国の「特務・女王捕獲計画」が動き出そうとしていた。

否応なく引き裂かれようとするイスカとアリスは、

その運命に抗うことができるのか――。