《我们仍未知道那天所看见的花的名字。》

从小时候起一直青梅竹马的6人，却在升上高中之后彼此有了距离。

不太与人们接触的主角宿海仁太、有点被小太妹熏染的安城鸣子、进入重点高中的松雪集与鹤见知利子、放弃读高中而展开旅行的久川铁道、只有幼年死去的本间芽衣子（灵魂，只有仁太能看见）还是一如从前。

有一天，芽衣子对仁太说：“帮我实现一个愿望吧”。

仁太虽然有点为难，却还是答应帮助面码实现愿望。

以此为契机，为了实现芽衣子的愿望，分散在各处的大家又再次地聚集在一起。